谁知道如何判断snp在mRNA上的位置?
来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/09 09:32:26
谁知道如何判断snp在mRNA上的位置?
谁知道如何判断snp在mRNA上的位置?
谁知道如何判断snp在mRNA上的位置?
1、你需要一定数量的样本,因为多态性的概念是基于人群的;
2、获取样本的细胞,抽提mRNA,逆转录得到cDNA;
3、对得到的cDNA进行测序,目前RNA测序的技术也是有的,总之,目的是确定每个样本mRNA序列;
4、对所有样本的序列进行比对,在某点上存在的SNP就可以确定了.
这是对所有SNP信息都不知道的情况下的做法,成本很高,如果了解SNP在某段ORF上,可以采用PCR的方法,但是DNA转录成RNA会有剪切等问题,一般SNP是在基因组上来确定的.
反转录,mRNA容易降解,一般要扩增或是测序,都要将它反转录成cDNA。
然后扩增,设计引物,将cDNA扩增,得到PCR产物,这时候的产物就可以直接送到测序公司测序了。
测序,只要把引物给他们点就行,等测序结果出来,就是你要的mRNA的序列了(记得看互补链),就可以找SNP。...
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反转录,mRNA容易降解,一般要扩增或是测序,都要将它反转录成cDNA。
然后扩增,设计引物,将cDNA扩增,得到PCR产物,这时候的产物就可以直接送到测序公司测序了。
测序,只要把引物给他们点就行,等测序结果出来,就是你要的mRNA的序列了(记得看互补链),就可以找SNP。
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