请问得到测序结果后,怎么在BLAST里证明测序的结果是我要的目的片段!

来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/11/09 04:33:39

请问得到测序结果后,怎么在BLAST里证明测序的结果是我要的目的片段!
请问得到测序结果后,怎么在BLAST里证明测序的结果是我要的目的片段!

请问得到测序结果后,怎么在BLAST里证明测序的结果是我要的目的片段!
1.首先把测序后的序列和你目的基因的序列都拿到
2.到这个网页
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PAGE_TYPE=BlastSearch&PROG_DEF=blastn&BLAST_PROG_DEF=megaBlast&SHOW_DEFAULTS=on&BLAST_SPEC=blast2seq&LINK_LOC=align2seq
3.在上面的大空格放入测序得到的序列,下面的那个放入目的基因的序列,为Job Title起一个名字.然后点“BLAST”就可以了.
4,结果会显示2个序列是否一致,有无变异等等.

将你自己的目的片段与测序结果一起输入（有两个填入的框）
然后软件会为你比对
你就可以知道测序结果中是不是包含你的目的片段，并且还可以知道是否发生的突变
当然你也可以采用最麻烦的方法
就是自己把你的目的片段序列与测序结果比对
呵呵
可以用NCBI上的Blast
比较方便...

全部展开

将你自己的目的片段与测序结果一起输入（有两个填入的框）
然后软件会为你比对
你就可以知道测序结果中是不是包含你的目的片段，并且还可以知道是否发生的突变
当然你也可以采用最麻烦的方法
就是自己把你的目的片段序列与测序结果比对
呵呵
可以用NCBI上的Blast
比较方便

收起

如果你没有这一段序列的话先获取着一段序列，进入ncbi首页，然后search后面database选nucleotide，输入你的序列关键词（你测序总有个基因什么的关键词是吧，如果你有着一段序列的代号就这届输入），获取你的目的序列的正确序列，把genebank格式切换到fasta（希望这几个字母没打错，我总觉得信息学的老师有种拍死我的冲动）格式，然后复制这一段序列
如果你手上有这一段序列的编...

全部展开

如果你没有这一段序列的话先获取着一段序列，进入ncbi首页，然后search后面database选nucleotide，输入你的序列关键词（你测序总有个基因什么的关键词是吧，如果你有着一段序列的代号就这届输入），获取你的目的序列的正确序列，把genebank格式切换到fasta（希望这几个字母没打错，我总觉得信息学的老师有种拍死我的冲动）格式，然后复制这一段序列
如果你手上有这一段序列的编码，那么直接进入ncbi首页，选择blast，选择nucleotide blast，然后你可以看到在输入序列的框下面有Align two or more sequences ，在前面的小框里打钩，上面一个框输入你的目的序列，下面一个框输入你的测序序列，就可以输入你的目的序列和测序结果了，如果结果看的不太懂的话可以接着来问啊

收起

在Blast的结果中看和你测序得到的片段100％匹配的序列如果是你的目的片段，那就证明没有问题

请问得到测序结果后,怎么在BLAST里证明测序的结果是我要的目的片段! 请问怎样剔除测序结果中的引物序列,进行BLAST 请教BLAST分析的含义和操作请问BLAST分析的意思,怎么进行BLAST分析, 【后处理】在abaqus里施加位移荷载,如何得到荷载位移曲线请问在abaqus里施加水平反复位移荷载,怎么得到荷载位移曲线? blast out of与blast through的区别?The road will have to be blasted out of solid rock.A 1.5 km tunnel was blasted through the mountain.请问在这里blast out of 与blast through区别在哪里?blast out the road of solid rock 怎么翻译呢 检测到一段N端氨基酸序列DNSCTGEHARYPMVWFIK,现要作PCR扩基因,在NCBI上blast找不同源的,请问怎么设计引根据质谱检测得到一段N端氨基酸序列DNSCTGEHARYPMVWFIK,现在需要作PCR扩基因,在NCBI上blast找不到同 blast结果如何分析 16srRNA 测序回来怎么分析引物是968F,1401r,得到的序列是1401-968=433bp么?我的去载体后是443bp,为什么呢?还有blast后我看不懂信息,不知怎么入手建树, BLAST怎么看是不是目的基因BLAST结果怎么看,怎么看是不是要扩增的目的基因? 请问在MATLAB中如何设置小数后的位数,可以到达7位吗?想要求得结果为根号3而不是1.732,和向得到分数结果而不是小数结果在MATLAB中药怎么设置? 知道引物序列怎么推算扩增片段查到用blast,但是具体提交了自己的上下游引物后怎么让它出结果呢 BLAST 蛋白比对求助请问测序结果和已公开序列的基因蛋白比对为99%,能否确定其为新基因还是未公开序列的基因中的某个?还需要做什么? ncbi blast具体应用问题：请问各位知道blast可以用来查询光合蛋白CP43/47在植物拟南芥和苔藓植物中的拷贝查询方法怎么操作的 具体点 请问NCBI dna BLAST结果中Max score、Total score、E value、Query Coverage、Max Ident 请问在ncbi上blast的时候,需要去除pcr扩增引物序列吗?如题,在blast的时候是否要保留当时做dna扩增时的pcr引物序列.……以前做的一个系列是通过提取重组质粒测序,不去引物的,但是现在做的内 blast 的结果怎么选啊怎么选什么结果是对我们有用啊 NCBI进行BLAST检索时Query coverage的同源百分比和Max ident的百分比分别是什么意思,怎么得到的?如果得分一样时,哪个结果所占比重比较大? 载体构建酶切位点的问题18—T克隆载体与目的基因连接后,送去测序,Blast之后得到序列,上面含有下一步的酶切位点,请问,目的基因序列包括酶切位点序列吗,师姐说不包括.酶切位点是PCR时加入