通过16srDNA鉴定细菌的疑惑1、为什么不能把PCR所得溶液直接用来测序,是测序技术的限制么?提供给测序公司的应该是转化阳性的菌液,还是提取出来的质粒?2、pcr产物跑胶后要胶回收再做载体连

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/11/06 09:56:10

通过16srDNA鉴定细菌的疑惑1、为什么不能把PCR所得溶液直接用来测序,是测序技术的限制么?提供给测序公司的应该是转化阳性的菌液,还是提取出来的质粒?2、pcr产物跑胶后要胶回收再做载体连
通过16srDNA鉴定细菌的疑惑
1、为什么不能把PCR所得溶液直接用来测序,是测序技术的限制么?提供给测序公司的应该是转化阳性的菌液,还是提取出来的质粒?
2、pcr产物跑胶后要胶回收再做载体连接,能否用pcr后溶液回收?
3、其操作流程是这样么?DNA提取---16srdna片段pcr扩增---跑胶检测---
胶回收---T载体连接---质粒转化---阳性克隆菌筛选(白色菌落)--提取质粒?--送去测序

通过16srDNA鉴定细菌的疑惑1、为什么不能把PCR所得溶液直接用来测序,是测序技术的限制么?提供给测序公司的应该是转化阳性的菌液,还是提取出来的质粒?2、pcr产物跑胶后要胶回收再做载体连
1. PCR所得溶液必须经过纯化后才能进行测序.因为PCR反应中的残留物很多,都会影响测序的结果,可以说是测序技术的限制.目前PCR完后用酒精醋酸钠进行纯化,再上机检测.菌液和质粒都可以进行测序.
2.PCR产物跑胶的目的是找到目的条带,因为在你PCR的过程中也许会产生一些非特异性的扩增,这些是不能拿去做转化的.所以跑玩PCR后要跑胶,找到目的片段再进行切胶回收.溶液回收是不行的.
3.基本流程就是这样的.DNA提取完了以后还是要跑胶检测的,测定DNA提取的效果和浓度.胶回收一定是找到目的片段的胶才能切胶回收,非目的片段的是没有用的.扩增不需要用高保真酶,TAQ酶会在产物末端直接加上A碱基,能直接和T载体连接,方便的很.

1 直接PCR溶液中含有酶、缓冲体系会干扰测序的进行,因此不能直接测序。现在提供给测序公司的可以是菌液也可以是质粒,二者价格略有不同。
2 基本不行。因为可能会有少量非特异性条带存在。但是如果你采用的是高特异性PCR,则产物可直接进行连接。
3 实际上,你扩增应该用高保真酶,如Pfu、KOD等。扩增结束后用Taq加上A末端。然后割胶回收,连接载体。...

全部展开

1 直接PCR溶液中含有酶、缓冲体系会干扰测序的进行,因此不能直接测序。现在提供给测序公司的可以是菌液也可以是质粒,二者价格略有不同。
2 基本不行。因为可能会有少量非特异性条带存在。但是如果你采用的是高特异性PCR,则产物可直接进行连接。
3 实际上,你扩增应该用高保真酶,如Pfu、KOD等。扩增结束后用Taq加上A末端。然后割胶回收,连接载体。

收起

1.质粒
2.否
3.是

通过16srDNA鉴定细菌的疑惑1、为什么不能把PCR所得溶液直接用来测序,是测序技术的限制么?提供给测序公司的应该是转化阳性的菌液,还是提取出来的质粒?2、pcr产物跑胶后要胶回收再做载体连 细菌如何提取16srDNA(用来做种类鉴定的) 细菌现在已经16SrDNA鉴定到了属,其中有几个的比对的同源性100%.其他的我需要鉴定到种怎么办?呵呵 测出来的序列里找不到pcr 引物序列我用16srdna鉴定细菌,拼出来的序列里面找不到PCR引物序列,有没有可能会影响结果.这个序列到底是不是鉴定菌的序列啊 您说的这个引物是所有细菌的都可以用?还是用于肠杆菌科的?还是用于芽孢杆菌的?有可以鉴定所有细菌16SrDNA的全长序列吗? 细菌的PCR扩增为什么要使用细菌基因的16SrDNA通用引物? 得到菌株的16SrDNA序列后,怎么鉴定菌株的分类地位?我从土壤中分离出来一些细菌,要鉴定它们是什么种,并最后构建系统发育树.我把这些菌株制备了菌液,并做了16SrDNA的扩增,现在得到了序列.拿 16SrDNA测序后在ncbi上比对细菌鉴定,16SrDNApcr扩增测序之后用blast比对,出来一个相似度99%的菌种,怎样体现数据库也是用16SrDNA序列跟我做的序列匹配的呢?换句话说,我想知道这99%相似度是不是我 细菌16S rDNA 序列比对,菌种鉴定中,已测出待定菌种的16SrDNA序列.那么:1、在NCBI上比对时,有三个属的多个已知菌种与新菌匹配率都95%以上,值最高的那个属其实真的在预料之外,而且文献中也没 细菌的18srDNA是怎么回事啊,和16srDNA有什么区别,老师让我测18的,可是一点头绪都没有, 关于已知DNA序列在NCBI上比对并鉴定菌种1.我做细菌鉴定,把16srDNA PCR后拿出去双向测序,得到了两条序列,一条正的,一条反的,在比对以前是要把它整合成一条链吗?怎样整合?如何鉴定.两条链如下 请问细菌16SRDNA 测序,测出来的序列里面找不到引物,序列还可靠吗?我做了细菌16SRDNA 测序,但是测序后拼接引物后找不到引物,测出来的序列是对的吗 细菌鉴定的意义 16SrDNA是干什么用的 16SrDNA与16SrRNA的区别在NCBI上找一细菌的16SrDNA序列,用来做同源性分析,查到的都是16SrRNA序列信息,该怎么操作啊?请教在NCBI上同源性分析的具体步骤,着急, 关于DNA序列在NCBI上比对的问题1.我做细菌鉴定,把16srDNA PCR后拿出去测序,得到了两条序列,一条正的,一条反的,在比对以前是要把它整合成一条链吗?怎样整合?2.请大概说一下,我想知道是什么菌, S rDNA基因的V3区引物与16SrDNA 基因序列的扩增采用细菌通用引物之间有什么区别呢? 请问什么是16SrDNA?